(一)性成熟年龄与个体大小
鳄龟是变温动物，其性成熟年龄与水温条件密切相关。不同地区、不同的气候条件下，鳄龟的有效积温不同，性成熟年龄也不同。在常温条件下，华北、东北地区鳄龟的个体性成熟需4-5 年，华中与华北地区则需3-4 年，华南与我国台湾省只需2-3 年。尽管各地鳄龟的性成熟年龄不同，但达到性成熟的有效积温则相近。因此无论何地区只需将鳄龟置于人工控制的温室内，使鳄龟在30℃ 的水温下生长，2 足龄的鳄龟则完全可达性成熟。
鳄龟的性成熟除了与当地的有效积温有关外，还与年龄有关，而与个体大小无直接关系。因为在自然环境下，由于受环境、饵料等因子的影响，鳄龟性成熟的个体差异较大。通常，性成熟的最小个体为1 千克左右(曾发现温室培养内个体仅600 克的雌鳄龟性腺发育成熟并有交配、产卵行为，这是种质退化的不正常现象)。研究表明3-6 千克的亲鳄龟繁殖力最强。因此在亲鳄龟选育时，同一年龄，个体越大，质量越好。
(二)雌雄鉴别
鳄龟的雌雄鉴别最显著的标志为：雄鳄龟尾长略粗，躯体稍长，尾长大于腹甲长度的86 写，泄殖孔位于背甲边缘之外;雌鳄龟尾短略细，躯体稍圆，尾长小于腹甲长度的86 % ，泄殖孔位于背甲边缘之内。
(三)发情与交配
在长江流域以南地区，每年惊蛰过后当水温回升到15 ℃ 以上时，鳄龟冬眠结束，逐渐复苏并恢复摄食。当水温上升到20 ℃ 以上时，开始发情交配(又称交尾)。交配盛期一直延续到10 月份。发情交配时间一般在傍晚进行。在野生水域中，鳄龟的初次成熟择偶处于随机状态。据观察，鳄龟在封闭性的生态环境中，其择偶表现得较为专一，特别是5 龄以上的雌性大鳄龟，在平时生活中与雄鳄龟形影不离，往往结伴同行，即使在非交配季节，当配偶一方失踪时另一方仍会在失踪处寻找等候。雄鳄龟交配前有明显的发情行为：潜游、戏水。雄鳄龟在沿岸浅水追逐雌鳄龟，若同时有其他雄鳄龟，则会发生撕咬争斗现象。当发情到高潮时，雄鳄龟用四胶紧抱雌鳄龟，骑背交配。此时雄鳄龟尾部下垂使泄殖孔与雌鳄龟泄殖孔对接，并将其交接器插人雌鳄龟泄殖腔内，输射精液至输卵管内，精卵在输卵管上端结合，完成受精过程。发情追逐时间可达5-6 小时，而交配过程仅5-8 分钟即完成。经过2-3 周后鳄龟再行交配，通常一年可交配2-3 次。
(四)产卵
在长江流域，春天鳄龟交尾2 周后，到5 月下旬开始产卵，7 月中、下旬结束，通常6 月份为产卵高峰期;而在广东省南部、台湾省和海南省，4 月下旬至8 月下旬均能产卵。产卵通常在下半夜进行，至天亮以前完成。因为这段时间环境最安静、也最安全。产卵亲鳄龟在午夜先从水中伸出头来探望，待确认无危险后才爬上岸来，选择合适的产卵场地。产卵场地要求隐蔽性良好，沙质土，并有一定的湿度。鳄龟喜欢在安静、隐蔽、保温、保湿的沙地产卵，沙粒直径为0.6 毫米左右。鳄龟选择好产卵场后，便用前肢和后肢交替挖一个直径5-8 厘米、深10-15 厘米的洞穴，洞穴的大小、深度与雌鳄龟的体重和产卵数量有关。挖一个穴通常约花半小时左右。穴挖成后鳄龟即将尾部伸人其中产卵。产卵时鳄龟的身体紧张而有节律地收缩，收缩一次产一枚卵，卵离开泄殖孔先落到内弯的尾柄上，然后尾巴徐徐下垂，卵即滑人洞底，以避免卵壳摔破。卵在穴内分2-3 层排列。产卵时间一般需要半个小时以上。卵产完后，雌鳄龟用后肢将沙土盖没洞穴，再用腹甲将沙土压平，并伪装得与周围环境相似。鳄龟的这种本能，既使鳄龟卵避免了太阳直射，防止了水分蒸发，又逃避了敌害生物的侵袭，使鳄龟卵能正常孵化。
(五)卵的特性
鳄龟卵为多黄卵，无气室，无浓缩的蛋白系带。卵子在输卵管上端与精子结合成为受精卵。受精卵经输卵管的分泌作用，使卵子外围包裹蛋白、壳膜和钙质卵壳。鳄龟卵的卵径和重量差距较大，其变化幅度为，卵径2 . 5-3 . 5 厘米，卵重7-15 克，通常大多数的卵径为2 . 8-3 . 2 厘米，卵重9-12 克。
(六)产卵数量
鳄龟引进中国，一年产卵一次。每次产卵数量及卵粒的大小与亲鳄龟的个体大小、年龄、饵料丰欠以及它们所处的地理位置等密切有关。鳄龟产卵时间在北方为7 月份，在长江流域为5-6 月份，在台湾省和海南省4-5 月份。雌鳄龟每次产卵数量相差很大，少至10 枚，多至数十枚不等，一般每次产卵10-80 枚。根据解剖观察，怀有成熟卵泡的数量和产卵次数是随个体年龄和重量的增加而增加。如体重2 . 5-2 . 75 千克的雌鳄龟，怀有成熟卵泡30-50 个;3-4 千克的雌鳄龟有成熟卵泡50-70 个;5 千克以上的雌鳄龟有70-110 个。按体重计算，每千克每年平均可产卵20 枚左右。从理论上讲，一个成熟卵泡应产生一个受精卵，但实际上只有卵径达到27-30 毫米的卵才能成熟排卵。因此真正产卵的数量仅占卵泡数的一半左右，其主要原因是受营养的限制，致使卵泡无法进一步发育成熟。生产上可通过对亲鳄龟的强化培育、延长日照时间和升高水温等方法来提高其繁殖力。
